マイクロアレイ/NGSの実験からデータ解析まで、トータルでサポートします。

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受託解析サービス

遺伝子発現受託解析 (マイクロアレイ, NGS)
実験の計画からデータ解析（データマイニングサポート）までを一貫してサポートいたします。

マイクロアレイ受託解析

Affymetrix®、Agilent Technologies、Illumina®の各社の遺伝子発現解析用マイクロアレイを選択していただけます。miRNA, arrayCGH, カスタムアレイ等のアプリケーションにも対応可能です。RNAサンプルの抽出精製等の実験サポートのご相談にも応じます。

NGS受託解析

RNA-seq, scRNA-seq, de novo assembly, ChIP-seq, Cancer Panel (SNV, CNV) など。サンプルの抽出精製等の実験サポートのご相談にも応じます。

データマイニング

膨大な遺伝子発現データから、実験の目的に合わせた解析を様々なbioinformatics的手法を用いて行ないます。

これら以外にもお客様のご要望に応じ、種々のバイオインフォマティクス解析（オーソログ対応、転写配列解析、SNP解析、既知薬剤標的遺伝子、リガンド-受容体の抽出等）を請け負います。

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更新情報

2023 年 3 月 6 日
Publications の更新（2023年）
  • Hayashi, Y., Kimura, S., Yano, E., Yoshimoto, S., Saeki, A., Yasukochi, A., Hatakeyama, Y., Moriyama, M., Nakamura, S., Jimi, E., & Kawakubo-Yasukochi, T. (2023). Id4 modulates salivary gland homeostasis and its expression is downregulated in IgG4-related disease via miR-486-5p. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) – Molecular Cell Research, 1870(2), 119404. https://doi.org/10.1016/j.bbamcr.2022.119404
  • Otsuji, R., Fujioka, Y., Hata, N., Kuga, D., Sangatsuda, Y., Takigawa, K., Funakoshi, Y., Sako, A., Yamamoto, H., Nakamizo, A., Mizoguchi, M., & Yoshimoto, K. (2023). Liquid biopsy with multiplex ligation-dependent probe amplification targeting cell-free tumor DNA in cerebrospinal fluid from patients with adult diffuse glioma. Neuro-Oncology Advances, 5(1). https://doi.org/10.1093/noajnl/vdac178

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Publications の更新（2022年）
  • Munemura, R., Maehara, T., Murakami, Y., Koga, R., Aoyagi, R., Kaneko, N., Doi, A., Perugino, C. A., Della-Torre, E., Saeki, T., Sato, Y., Yamamoto, H., Kiyoshima, T., Stone, J. H., Pillai, S., & Nakamura, S. (2022). Distinct disease-specific Tfh cell populations in 2 different fibrotic diseases: IgG4-related disease and Kimura disease. Journal of Allergy and Clinical Immunology, 150(2), 440-455.e17. https://doi.org/10.1016/j.jaci.2022.03.034
  • Yokoyama, K., Mitoma, H., Kawano, S., Yamauchi, Y., Wang, Q., Ayano, M., Kimoto, Y., Ono, N., Arinobu, Y., Akashi, K., Horiuchi, T., & Niiro, H. (2022). CEACAM 1, 3, 5 and 6 -positive classical monocytes correlate with interstitial lung disease in early systemic sclerosis. Frontiers in Immunology, 13. https://doi.org/10.3389/fimmu.2022.1016914
  • Hatano, S., Mine, K., Noguchi, N., Matsumoto, M., Baba, Y., & Yoshikai, Y. (2022). MHC class II inhibits the generation of IL‐17A + Vγ6 γδ T cells in the thymus at perinatal stage. European Journal of Immunology, 52(8), 1366–1368. https://doi.org/10.1002/eji.202149542
  • Kanemura, H., Hayashi, H., Tomida, S., Tanizaki, J., Suzuki, S., Kawanaka, Y., Tsuya, A., Fukuda, Y., Kaneda, H., Kudo, K., Takahama, T., Imai, R., Haratani, K., Chiba, Y., Otani, T., Ito, A., Sakai, K., Nishio, K., & Nakagawa, K. (2022). The Tumor Immune Microenvironment and Frameshift Neoantigen Load Determine Response to PD-L1 Blockade in Extensive-Stage SCLC. JTO Clinical and Research Reports, 3(8), 100373. https://doi.org/10.1016/j.jtocrr.2022.100373
  • Miyata, N., Ito, T., Nakashima, M., Fujii, S., & Kuge, O. (2022). Mitochondrial phosphatidylethanolamine synthesis affects mitochondrial energy metabolism and quiescence entry through attenuation of Snf1/AMPK signaling in yeast. The FASEB Journal, 36(7). https://doi.org/10.1096/fj.202101600RR
  • Shinkawa, T., Ohuchida, K., Mochida, Y., Sakihama, K., Iwamoto, C., Abe, T., Ideno, N., Mizuuchi, Y., Shindo, K., Ikenaga, N., Moriyama, T., Nakata, K., Oda, Y., & Nakamura, M. (2022). Subtypes in pancreatic ductal adenocarcinoma based on niche factor dependency show distinct drug treatment responses. Journal of Experimental & Clinical Cancer Research, 41(1), 89. https://doi.org/10.1186/s13046-022-02301-9
  • Otsuka, H., Yokomizo, H., Nakamura, S., Izumi, Y., Takahashi, M., Obara, S., Nakao, M., Ikeda, Y., Sato, N., Sakamoto, R., Miyachi, Y., Miyazawa, T., Bamba, T., & Ogawa, Y. (2022). Differential effect of canagliflozin, a sodium–glucose cotransporter 2 (SGLT2) inhibitor, on slow and fast skeletal muscles from nondiabetic mice. Biochemical Journal, 479(3), 425–444. https://doi.org/10.1042/BCJ20210700

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